Ярослав Забояркин окончил Санкт-Петербургскую государственную консерваторию имени Н. А. Римского-Корсакова по специальностям «скрипка» (2011) и «оперно-симфоническое дирижирование» (2016). В числе его наставников такие известные дирижеры, как Юрий Темирканов, Неэме Ярви, Пааво Ярви, Станислав Горковенко, Василий Синайский и Михаил Кукушкин. Лауреат и дипломант международных конкурсов в России, Франции, Хорватии, Польше, Италии и Японии, в том числе Международного конкурса дирижеров имени Гжегожа Фительберга в Катовице (Польша).
После окончания консерватории играл в составе Заслуженного коллектива России Академического симфонического оркестра Санкт-Петербургской филармонии. В 2019 году впервые выступил за пультом этого коллектива на сцене Большого зала Санкт-Петербургской филармонии в рамках абонемента «Дебюты молодых дирижеров». В 2020 году основал Молодежный камерный оркестр ЗКР АСО Санкт-Петербургской филармонии, с которым ведет активную концертную деятельность, уделяя особое внимание музыке композиторов XX–XXI веков.
Сотрудничает также с Академическим симфоническим оркестром Санкт-Петербургской филармонии, Симфоническим оркестром Мариинского театра, Российским национальным оркестром, Московским государственным академическим симфоническим оркестром, Академическим симфоническим оркестром Северо-Кавказской филармонии, Губернаторским симфоническим оркестром Санкт-Петербурга и Санкт-Петербургским государственным академическим симфоническим оркестром. Выступал со многими известными солистами, среди которых Вадим Репин, Александр Рудин, Андрей Коробейников, Полина Осетинская, Елена Стихина, Олеся Петрова, Нарек Ахназарян, Мирослав Култышев, Никита Борисоглебский, Николя Бальдеру, Сергей Елецкий, Лукас и Артур Юссены.
Участник международных фестивалей «Площадь искусств» и «Музыкальная коллекция» в Санкт-Петербурге, «Территория мира – Территория музыки» в Калининграде, Музыкального фестиваля в Пярну (Эстония) и других. В сезоне 2022/23 дебютировал в Московском концертном зале «Зарядье» и Концертном зале Мариинского театра.
