Марат Фатхутдинов родился в 2008 году в Свердловской области. Обучался в городской Детской музыкальной школе (класс Евгения и Светланы Смирновых). С 2020 года продолжил образование в Средней специальной музыкальной школе Санкт-Петербургской государственной консерватории имени Н. А. Римского-Корсакова (класс Екатерины Кулагиной). Участник мастер-классов Владимира Кознова, Сергея Колесова, Никиты Зимина, Леонида Друтина, Виталия Ватули, Михаила Казакова; образовательных программ центров «Сириус» и «Артек», Летней творческой школы «Новые имена» в Суздале.
Лауреат конкурсов WoodwindBrassPremium (Беларусь, 2021, I степень), Goodwin Art (Москва, 2021 и 2022, I степени), Cuore D’Italia (Италия, 2021, I степень), Russian Woodwinds FEST (Москва, 2021, II степень), к 140-летию со дня рождения И. Ф. Стравинского (Санкт-Петербург, 2022, III степень), Cherry Saxophon Competition (Москва, 2022, Гран-при), «Молодые дарования России» (Москва, 2022, II степень), «Жар-птица России» (Москва, 2023, I степень), «Невский ветер» (Санкт-Петербург, 2023, I степень), «Финист» (Санкт-Петербург, 2024, I степень), VII Санкт-Петербургского открытого конкурса юных исполнителей на духовых и ударных инструментах (2024, I степень), конкурсов фонда «Новые имена» (Москва, 2024) и др.
Выступал сольно и в составе разных коллективов в залах Санкт-Петербурга (Малый зал филармонии, Белый зал Политехнического университета, Государственная академическая капелла и др.), Москвы, Екатеринбурга, Сочи и других городов.
Участвовал в Фестивале культуры и искусств народов России (Екатеринбург, 2019), Музыкальной академии атомных городов под патронатом Юрия Башмета (Снежинск, 2020), фестивале «Чайковский. Перезагрузка» (Санкт-Петербург, 2023 и 2024), Всемирном фестивале молодежи (Сочи, 2024).
Выступал с оркестром Военно-морской академии имени адмирала флота Советского Союза Н. Г. Кузнецова (дирижер – Дмитрий Мисюра), Симфоническим оркестром Ленинградской области (дирижер – Михаил Голиков).
С 2021 года выступает в составе квартета «Игра саксофонов» и духовом оркестре музыкальной школы при Санкт-Петербургской консерватории.